软件工程专业适应国家加快实施创新驱动发展战略，满足社会对高层次、复合型、创新型软件技术人才的迫切需求，培养软件系统分析师、系统架构师、高级工程师等高级软件技术人才。专业定位于复合型、创新型、国际化人才培养，以培养基础扎实、视野开阔、能够领导团队的创业领袖、优秀的系统分析师、架构师、软件工程师为目标，要求学生具备软件开发工作所需基础知识与规范熟练的开发技能，具备一定的项目开发经验、管理能力和综合性技术素质，胜任知名IT公司、金融机构、事业单位及政府机关等相关岗位工作。毕业以上免试去向：毕业生30%以上免试推荐或考取研究生，14%以上自费出国留学或入选南开大学“百名后备师资培养计划”公派出国，主要去向为清华、北大、南开、中科院以及美国哥伦比亚大学、加利福尼亚大学洛杉矶分校、澳大利亚悉尼大学、日本东京大学、香港中文大学、香港科技大学等。近五年，软件工程专业毕业生薪资水平始终保持在南开大学前三名。就业去向集中在北京、上海、天津、深圳等知名IT、通讯、电力、银行、保险等企业以及党政机关、事业单位，如：百度、阿里巴巴、腾讯、华为、农业银行、工商银行、国家电网、中国移动等。